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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
14/04/2015 |
Data da última atualização: |
30/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; MOAWAD, M. S.; SELIM, S. A.; GARALDI, A. L. M.; MIYOSHI, A.; RIBEIRO, M. G.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. |
Afiliação: |
ELAINE M. S. DORNELES, UFMG; JORDANA A. SANTANA, UFMG; DAYANA RIBEIRO, UFMG; FERNANDA ALVES DORELLA, UFMG; ALESSANDRO DE SA GUIMARAES, CNPGL; MOHAMED S. MOAWAD, Cairo University, Cairo, Egypt; SALAH A. SELIM, Cairo University, Cairo, Egypt; ANA LUIZA M. GARALDI, UNERJ; ANDERSON MIYOSHI, UFMG; MARCIO G. RIBEIRO, UNESP; AURORA M. G. GOUVEIA, UFMG; VASCO AZEVEDO, UFMG; MARCOS B. HEINEMANN, UFMG; ANDREY P. LAGE, UFMG. |
Título: |
Evaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 9, n. 6, e98758, 2014. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. |
Palavras-Chave: |
Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR). |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122336/1/Cnpgl-2014-PlosOne-Evaluation.pdf
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Marc: |
LEADER 02105naa a2200301 a 4500 001 2013504 005 2024-01-30 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758$2DOI 100 1 $aDORNELES, E. M. S. 245 $aEvaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. 653 $aEnterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) 700 1 $aSANTANA, J. A. 700 1 $aRIBEIRO, D. 700 1 $aDORELLA, F. A. 700 1 $aGUIMARAES, A. S. 700 1 $aMOAWAD, M. S. 700 1 $aSELIM, S. A. 700 1 $aGARALDI, A. L. M. 700 1 $aMIYOSHI, A. 700 1 $aRIBEIRO, M. G. 700 1 $aGOUVEIA, A. M. G. 700 1 $aAZEVEDO, V. 700 1 $aHEINEMANN, M. B. 700 1 $aLAGE, A. P. 773 $tPlos One$gv. 9, n. 6, e98758, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 22 | |
1. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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2. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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3. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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4. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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5. | | GUIMARAES, A. S.; CARMO, F. B.; HEINEMANN, M. B.; PORTELA, R. W. D.; MEYER, R.; LAGE, A. P.; SEYFFERT, N.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G. High sero-prevalence of caseous lymphadenitis identified in slaughterhouse samples as a consequence of deficiencies in sheep farm management in the state of Minas Gerais, Brazil. BMC Veterinary Research, v. 7, article 68, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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6. | | LOBO, F. P.; RODRIGUES, M. R.; RODRIGUES, G. O. L.; HILÁRIO, H. O.; SOUZA, R. A.; TAUCH, A.; MIYOSHI, A.; FRANCO, G. C.; AZEVEDO, V.; FRANCO, G. R. KOMODO: a web tool for detecting and visualizing biased distribution of groups of homologous genes in monophyletic taxa. Nucleic Acids Research, Oxford, v. 40, p. W491-W497, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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7. | | GUIMARAES, A. S.; DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; LAGE, A. P.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolates using ERIC-PCR. Veterinary Microbiology, v. 153, n. 3/4, p. 299-306, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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8. | | MIYOSHI, A.; ROSINHA, G. M. S.; CAMARGO I. L. B. C.; TRANT, C. M. C.; CARDOSO, F. C.; AZEVEDO, V.; OLIVEIRA, S. C. The role of the vacB gene in the pathogenesis of Brucella abortus. Microbes and infections, v. 9, n. 3, p. 375-381, Mar. 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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9. | | GOUVEIA, A. M. G.; SILVA, M. X.; MAIA, J. M. S.; BRANDAO, H. de M.; SEYFFERT, N.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GUIMARAES, A. S. Technological level and epidemiological aspects of sheep husbandry in Minas Gerais, southeastern Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 34, n. 9, p. 865-868, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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10. | | MARTINS, R. de J.; VESCHI, J. L. A.; CARMO, F. B.; AZEVEDO, V.; SEYFFERT, N; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; PEIXOTO, R. M.; COSTA, M. M. da; ZAFALON, L. F.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliação da presença de anticorpos anti-Corynebacterium pseudotuberculosis em caprinos leiteiros do Território do Sisal, BA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 5., 2010, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2010. p. 25-31. (Embrapa Semiárido. Documentos, 228.).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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11. | | MARTINS, R. de J.; VESCHI, J. L. A.; LANDIM, A. M. de S.; CARMO, F. B. do; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; ZAFALON, L. F.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliação da presença de anticorpos anti-Corynebacterium pseudotuberculosis em ovinos do Município de Dormentes, PE In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 6., 2011, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2011. p. 397-403. (Embrapa Semiárido. Documentos, 238).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Semiárido. |
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12. | | PACHECO, L. G. C.; PENA, R. R.; CASTRO, T. L. P.; DORELLA, F. A.; BAHIA, R. C.; CARMINATI, R.; FROTA, M. N. L.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; ALVES, F. S. F.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. Multiplex PCR assay for identification of Corynebacterium pseudotuberculosis from pure cultures and for rapid detection of this pathogen in clinical samples. Journal of Medical Microbiology, v. 56, n. 4, p. 480-486, Apr. 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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13. | | CARMO, F. B. DO; GUIMARAES, A. S.; PAULETTI, R. B.; LAGE, A. P.; GONÇALVES, V. S. P.; MEYER, R.; PORTELA, R. W. B.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Prevalência de anticorpos contra a linfadenite caseosa em criações comerciais de ovinos no Distrito Federal, Brasil. Arquivos do Instituto Biológico, v. 79, n. 2, p. 293-298, 2012.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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14. | | DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. DE S.; SANTANA, J. A.; LAGE, A. P.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. DE S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using ERIC-PCR. In: Encontro Nacional de Patologia Veterinária, 15., 2011, Goiânia. Resumos...Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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15. | | DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. DE S.; SANTANA, J. A.; LAGE, A. P.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. DE S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using eric-PCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu. Resumos. Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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16. | | DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. S.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; LAGE, A. P.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using ERIC-PCR. Genetics and Molecular Research, v. 153, n. 3/4, p. 299-306, 2011Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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17. | | DORELLA, F. A.; ESTEVAM, E. M.; PACHECO, L. G. C.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. P.; GOMES, E. A.; BARSANTE, M. M.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. In vivo insertional mutagenesis in Corynebacterium pseudotuberculosis: an efficient means to identify DNA sequences encoding exported proteins. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 72, n. 11, p. 7368-7372, 2006.Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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18. | | ANTUNES, C. A.; GUIMARAES, A. S.; SILVA, W. M.; CASTRO, T. L. DE P.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; SILVA, R. DE F.; GALA-GARCIA, A.; CARVALHO, R. D. DE O.; MORAES, P.; ROCHA, F. S.; MAGALHÃES, A.; ALMEIDA, S. S. DE; EL AOUAR FILHO, R. A.; GOUVEIA, A. M. G.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; SEYFFERT, N. Avaliação de um teste intradérmico de hipersensibilidade com antígenos secretados de Corynebacterium pseudotuberculosis para o diagnóstico subclínico da linfadenite caseosa em caprinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu. Resumos. Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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19. | | DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; MOAWAD, M. S.; SELIM, S. A.; GARALDI, A. L. M.; MIYOSHI, A.; RIBEIRO, M. G.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. Evaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates. Plos One, v. 9, n. 6, e98758, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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20. | | PEREIRA, U. de P.; SANTOS, A. R. dos; HASSAN, S. S.; ABURJAILE, F. F.; SOARES, S. de C.; RAMOS, R. T. J.; CARNEIRO, A. R.; GUIMARÃES, L. C.; ALMEIDA, S. S. de; DINIZ, C. A. A.; BARBOSA, M. S.; SÁ, P. G. de; ALI, A.; BAKHTIAR, S. M.; DORELLA, F. A.; ZERLOTINI, A.; ARAÚJO, F. M. G.; LEITE, L. R.; OLIVEIRA, G.; MIYOSHI, A.; SILVA, A.; AZEVEDO, V.; FIGUEIREDO, H. C. P. Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks. Standards in Genomic Sciences, v. 8, n. 2, p.188-197, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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